通过MGLTools-1.5.6软件将pdbqt文件转换成pdb文件
作者:shims
在分析AutoDock分子对接结果的时候保存的受体与配体的分子结构文件是AutoDock使用的扩展pdb后的pdbqt格式的文件,那么如何将pdbqt格式的文件转换成大部分分子结构查看软件,如PYMOL,VMD等能识别的pdb格式文件呢?
这里使用的是制作AutoDock分子对接处理的图形化软件MGLTools来实现,这里使用的版本是1.5.6。通过File-Read Molecule打开需要转换的pdbqt文件,需要注意这里会到默认的目录下去打开文件窗口,后面保存pdb文件也是默认保存在默认目录下。

在成功加载需要转换的pdbqt文件之后等待加载完成,如果体系比较大的话可能会有延迟,一定要等成功加载之后再执行下一步。通过File-S
作者:shims
在分析AutoDock分子对接结果的时候保存的受体与配体的分子结构文件是AutoDock使用的扩展pdb后的pdbqt格式的文件,那么如何将pdbqt格式的文件转换成大部分分子结构查看软件,如PYMOL,VMD等能识别的pdb格式文件呢?
这里使用的是制作AutoDock分子对接处理的图形化软件MGLTools来实现,这里使用的版本是1.5.6。通过File-Read Molecule打开需要转换的pdbqt文件,需要注意这里会到默认的目录下去打开文件窗口,后面保存pdb文件也是默认保存在默认目录下。
在成功加载需要转换的pdbqt文件之后等待加载完成,如果体系比较大的话可能会有延迟,一定要等成功加载之后再执行下一步。通过File-S
