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今天分享的文献:
Long non-coding RNA CCAL regulates colorectal cancer progression by activating Wnt/β-catenin
这是一篇来自于GUT（IF 14，4/24/2015）的文章。
这篇文献主要是一个工作量的体现。前期的筛选工作基础很多，并且有10年左右的随访记录，这是本文的亮点。另外加上组蛋白修饰调控lncRNA的表达，以及傍了个大款Wnt/β-catenin信号通路。其他都是一些常规化的实验套路。
作者发现了一个lncRNA受到组蛋白甲基化下调。对照上述组蛋白修饰作用，可以看到可能跟H3的9、27号赖氨酸甲基化有关，这块实验作者未做。
概括：作者发现了一个结直肠癌相关的lncRNA（CCAL）。在结直肠癌中（CRC），组蛋白H3的甲基化及去乙酰化作用能下调CCAL水平。而且CCAL能通过结合抑制AP-2α，激活Wnt/β-catenin信号通路，促使CRC进程，并且上调MDR1/P-gp表达，诱导多药耐药。
本文主要内容如下：
1、发现并验证CCAL
2、CCAL功能验证
3、功能的机制研究
1、发现并验证CCAL
作者在正常结直肠样本、结直肠腺瘤、CRC中发现了一些具有差异表达的编码及长链非编码RNAs。确定了CCAL，并且通过共表达模块发现CCAL跟一个lncRNA、11个编码基因有关联，参与多种生物学进程。
表达：在肿瘤细胞中的表达水平最高，正常组织中的表达水平最低。
在结直肠上皮细胞（正常细胞和含癌细胞）中的表达，含癌的结直肠上皮细胞中的表达量高。
定位：CCAL主要定位于胞浆
CCAL跟预后相关，其表达量越高预后越差
CCAL的表达成为辅助化疗应答的独立预测因素
2、CCAL的功能验证
敲减CCAL能显著降低肿瘤细胞的增殖，而过表达后能提升增殖作用。
CCAL能抑制细胞凋亡，使得细胞停滞在G1期
敲减CCAL能减缓肿瘤细胞的迁移侵润
动物实验、细胞实验表明CCAL能促进CRC进程
3、机制研究
降低组蛋白H3甲基化、增加乙酰化作用能上调CCAL表达
RNA pull-down实验拉下并验证AP-2α蛋白
作者上调CCAL后发现AP-2α表达水平下降了（蛋白水平变化有几种原因，具体请看前期蛋白调控方式），而AP-2α的mRNA水平并没有变化。作者做了是否是CCAL影响了AP-2α的稳定性，然而试验不能说明问题。所以作者估计AP-2α被泛素化降解，而这部分试验作者并没有做。
又是拉关系：Wnt/β-catenin是一个明星通路，跟肿瘤的很多生物学进程相关。前期有报道，在CRC中，AP-2α能降低β-catenin/TCF-4的作用。作者就想能不能拉这么一个土豪做朋友呢。很庆幸，AP-2α、APC 、β-catenin能形成一个复合物。
而过表达CCAL的移植瘤中，β-catenin、c-myc、cyclin D1 、E-cadherin的表达水平提升，如敲减CCAL则表达水平降低。这表明CCAL通过抑制AP-2α，激活Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤增殖、转移等生物学进程。