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（文章篇）S4E23：一文看懂蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控模式aa

2016-07-15 18:59阅读：

http://blog.sina.cn/dpool/blog/u/5908556998

以前我们介绍过lncRNA-DNA-蛋白，RNA-RNA-蛋白的作用模式，今天介绍的这篇是蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控基因表达模式的文章。
The lncRNA SLNCR1 Mediates Melanoma Invasion through a Conserved SRA1-like Region （cell reports）
全文链接：http://pan.baidu.com/s/1mijJtZ6 密码：g6ee
先看机制图：
（文章篇）S4E23：一文看懂蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控模式aa
作者发现了一个lncRNA-SLNCR1，能与Brn3a、
AR形成三聚体，结合到MMP9启动子区，促进MMP9表达，实现黑色素瘤的侵袭作用。
本文作者，设计了一个实验方法RATA来检测与目标RNA结合的低表达的转录因子。有兴趣的可以细看。
文章的主要内容：
1、 SLNCR1的表达与黑色素瘤预后。
SLNCR1是SLNCR主要的亚型，含有四个外显子，其中存在一个高度保守的序列，该序列存在一个区域和SRA1具有高度同源性。并通过算法预测SLNCR的3个亚型均无蛋白编码能力。
黑色素瘤的厚度是一个很重要的预后指标。其厚度小于1mm则可以通过手术切除，而大于1mm则很有可能发生了转移。SLNCR在厚度大于1mm的黑色素瘤中的表达量显著增高。并且低表达SLNCR病人的中位生存期明显高于高表达病人。这预示着SLNCR跟临床相关。
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2、 沉默SLNCR1后能显著降低细胞侵袭，并且作者验证了SLNCR1的保守区序列起到侵袭的关键作用。
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（文章篇）S4E23：一文看懂蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控模式aa
过表达SLNCR1及其SLNCR1-cons，发现了2个显著上调的分子，包含MMP9。其中MMP9通过改造细胞外基质实现早期黑色素瘤的侵袭。并且MMP9在转移瘤中的表达水平要显著高于原发肿瘤。而在原发肿瘤中SLNCR1的表达能提升MMP9的表达水平，这标志着SLNCR1能调控MMP9的表达。
细胞实验验证了上调MMP9能促进由SLNCR1介导黑色素瘤侵袭。
并通过荧光素酶报告基因确定了SLNCR1上调MMP9的作用序列区域。
（文章篇）S4E23：一文看懂蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控模式aa
3、这部分有一个关键性实验，作者设计了一个RATA实验来检测与目标RNA结合的转录因子。
（文章篇）S4E23：一文看懂蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控模式aa
实验验证了Brn3a直接与SLNCR1保守区结合。AR则结合到保守区附近。具体参看上图标注内容。
4、第二部分内容发现SLNCR1能上调MMP9。作者验证了上述三聚体Brn3a-SLNCR1-AR是上调MMP9及肿瘤侵袭所必需的。
（文章篇）S4E23：一文看懂蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控模式aa
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但其中，敲减Brn3a能降低MMP9水平，但是却能提升黑色素瘤的侵袭。所以这种侵袭作用并非依赖MMP9水平的上升。作者发现Brn3a调控黑色素瘤侵袭通过两种途径：1、不依赖于SLNCR1、MMP9,2、与AR、SLNCR1结合上调MMP3，来实现侵袭作用。
5、最后验证了三聚体结合到MMP9启动子区，实现调控MMP9的表达。
（文章篇）S4E23：一文看懂蛋白-lncRNA-蛋白三聚体调控模式aa
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ok，这样一个蛋白-lncRNA-蛋白三聚体参与调控基因表达模式的文章完成！






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