为什么做饱和度检验
不是所有的序列,都适合用来构建进化树。当两条序列分化时间很远的时候,核苷酸会发生很多突变,会造成替换饱和。
怎么做饱和度检验
推荐使用一款软件 DAMBE
序列比对->序列修剪(使用相关的序列比对软件完成)
打开DAMBE软件,导入序列,选择seq.analysis-> measure substitution saturation -> test by xia et al
当ISS<0.05. 可以用来构建进化树
不是所有的序列,都适合用来构建进化树。当两条序列分化时间很远的时候,核苷酸会发生很多突变,会造成替换饱和。
怎么做饱和度检验
推荐使用一款软件 DAMBE
打开DAMBE软件,导入序列,选择seq.analysis-> measure substitution saturation -> test by xia et al
当ISS<0.05. 可以用来构建进化树
