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手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

2019-04-02 11:53阅读：

http://blog.sina.cn/dpool/blog/u/6011142785

作者：龚志忠


在上一期的内容中，我们讲到通过展示森林图，可以更加直观的将回归分析结果可视化。详见：一文带你玩转森林图！


在本期内容中，我们来实际操练一下，介绍几款常用的软件，教大家绘制出高质量的森林图。


下面我们以2016年发表在JACC杂志上的一篇文章《A Prospective Natural History Study of Coronary Atherosclerosis Using Fractional Flow Reserve》为例，利用文章中的Table 3多因素回归分析的结果来绘制森林图。



手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

 GraphPad Prism——论文绘图必备



GraphPad Prism是一款专门为医学专业人士设计的绘图软件，同时也兼顾统计分析的功能，操作便捷，可以帮助我们轻轻松松绘制出高质量的专业图形，简直就是科研人员的福利。


下面我们以GraphPad Prism 7为例，来介绍一下如何绘制回归分析结果的森林图。



1. 新建GraphPad Prism文件


在New Table & Graph下选择Column，利用软件提供的Metanlysis（Forest）plot教程数据新建一个GraphPad Prism文件。


手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

2. 录入数据


按照软件提供的教程数据模板，录入对应的变量名称、HR值以及95% CI。


手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』



3. 点击Graphs下级目录中的Metanalysis，即可发现软件已经自动生成了一个森林图雏形，但是我们还需要对图形的一些细节进行进一步调整。



手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

4. 调整坐标轴：双击坐标轴，进入Format Axes界面


4.1 首先，在Frame and Origin选项卡中设置坐标轴的起点（即无效线的坐标点），图形的形状、大小、位置，坐标轴的颜色、厚度等参数。




手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

4.2 然后，在X axis选项卡中设置X轴的参数，主要包括刻度范围，刻度方向、长度，X轴的起点和增量等信息，同时在Titles & Fonts选项卡中设置变量名称与Y轴的距离。
手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』
手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』
5. 调整图形元素：双击图片，进入Format Graph界面


5.1 首先，在Appearance选项卡中设置图形各个元素的细节，包括颜色、形状、大小、厚度等信息。

手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

5.2 然后，在Data Sets on Graph选项卡中调整变量名称的顺序。

手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』


此时再次点击Graphs下级目录中的Metanalysis，发现经过调整后的森林图如下图所示，已经基本符合要求了，但总觉得少一些什么。


手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』


6. 插入数据文件


如果想在森林图中进一步添加HR值、95% CI及对应的P值，可以在图形处单击右键，选择Insert Object → Excel Object，插入一个Excel文件，录入对应的数值即可。最终生成的森林图如下所示，就可以直接导出放在文章中了哈。



手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

 手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

Excel——办公家居标配



Excel作为Office办公三件套的标配之一，其处理数据和绘图的功能也是非常丰富的，它的强大足够超乎你的想象。相信大家对Excel的操作已经很熟悉了，那么怎样利用Excel绘制森林图呢？



我们以Excel 2013为例，虽然Excel里并没有直接提供绘制森林图的图形模板，但我们可以另辟蹊径，通过选择“插入→ 图表 → 所有图表 → 股价图 → 收盘图”来绘制森林图的雏形，如下图所示。


手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』


(Excel中录入数据)


手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

这是一个旋转了90°的森林图，我们在上一期内容中也介绍了类似的森林图，这种类似的图也经常能够在文献中看到，例如2018年发表在Arterioscler Thromb Vasc Biol杂志（影响因子：6.6）的一篇文章《High-Density Lipoprotein Cholesterol and Mortality Too Much of a Good Thing?》。


文中为了表达HDL-C水平与全因死亡之间的关联性（HR值），就采用了这种旋转了90°的森林图来表达分析结果，是不是和上面用Excel做出来的森林图雏形很相似呢。根据这种绘图风格，小咖深深怀疑这6.6分文章里的森林图就是用Excel搞定的。。。



手把手教绘制回归分析结果的森林图『GraphPadPrism和Excel』

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