R语言画条形图，柱状图
2018-11-14 16:16阅读：
https://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6912474.html
barplot柱状图用来表示测序得到的总的短片段reads的总数，不同样本有不同的总数，但都保持在一个数量级，相差不会太多。
barplot 函数用于绘制柱状图，下面对其常用的参数进行一个详细的解释：
1）height ： 高度，通过这个参数可以指定要画多少个柱子以及每个柱子的高度，其值有两种格式，
第一种 ：向量 vector， 此时会根据向量的长度确定图中有多少个柱子，向量中的每个值就是柱子的高度
代码示例：
barplot(height = 1:10)
效果图如下：
从图中可以看出，共有10个柱子，柱子的高度为1到10，和height 参数的向量保持一致；
第二种：矩阵，matrix, 此时用于画堆积柱状图
代码示例：
data <- cbind(a = 1:4, b = 1:4) barplot(data)
效果图如下：
从图中可以看出，输入的矩阵data一共有a和b两列，所以图中只有两个柱子，矩阵有4行，所以在每个柱子又由4个小的柱子堆积起来，所以矩阵常用来绘制堆积柱状图
需要注意的是，当输入参数为矩阵时，默认是堆积柱状图，这种默认行为其实是通过 beside 参数进行控制，beside 默认值为
FALSE, 当为TRUE 时，我们看下效果：
代码示例：
data <-
cbind(a = 1:4, b = 1:4) barplot(data, beside = T)
效果图如下：
从图中可以看到，当设置besdie = TRUE 时，原本堆积在一起的柱子现在变成并列的了；
2）width:
宽度，控制每个柱子的宽度，默认值为1，值得注意的是，这个参数的值是可以循环使用的，当我们只设置一个值时，会自动循环，生成长度和柱子数目相同的向量，效果就是所有柱子的宽度是一样的，其实也可以指定多个值，使每个柱子的长度不一样
代码示例：
barplot(1:5, width = 5:1)
效果图如下：
3）space：间隔，指定每个柱子左边的空白区域的宽度，这个值为一个百分比，默认值为0.2， 实际的间隔 = 0.2 *
1（所有柱子的平均宽度） = 0.2; 这个参数的值和width
参数类似，可以只设置一个值，也可以指定不同的柱子间隔不同；
代码示例：
barplot(1:3, space = c(0.1, 0.2, 0.3))
效果图如下：
4）names.arg : 每个柱子下面的标记，当height 为 vector 时，默认的标记为向量的names 属性，
当height 为 matrix 是，默认为 matrix 的colnames 属性
代码示例：
par(mfrow = c(1, 2)) height <- c(1:3) names(height) <- c('A',
'B', 'C') barplot(height) data <- cbind('A' = 1:4, 'B' = 1:4)
barplot(data)
效果图如下：
上面的默认用法，names.arg 参数的主要用途是当输入的height
缺少对应的属性时，自己手工赋值，或者对已有的属性不满意，重新赋值
代码示例：
par(mfrow = c(1, 2)) height <- c(1:3) names(height) <- c('A',
'B', 'C') barplot(height, names.arg = c('A1', 'A2', 'A3')) data
<- cbind('A' = 1:4, 'B' = 1:4) barplot(data, names.arg = c('D',
'E'))
效果图如下：
5） legned.text : 图例的文字说明， 只有当height参数的值是matrix
时，才起作用，默认显示的是matrix的rownames 属性，其值有两种指定形式，
第一种：逻辑值，是否需要显示图例，默认为FALSE
代码示例：
data <- cbind(a = 1:4, b = 1:4) rownames(data) <- c('A', 'B',
'C', 'D') barplot(data, legend.text = TRUE)
效果图如下：
第二种， 指定图例中的文字内容，相当于修改了matrix的 rownames 属性
代码示例：
data <- cbind(a = 1:4, b = 1:4) rownames(data) <- c('A', 'B',
'C', 'D') barplot(data, legend.text = c('E', 'F', 'G', 'H'))
效果图如下：
从上面两张图可以看出来，虽然可以通过这种方式显示图例，但是图里的位置都是固定在了右上角，会出现和柱子重叠的情况，最佳的显示办法还是单独调用legend
函数，添加图例；
6）beside： 之前提到过的，控制group bar的排列方式， 默认FALSE， 堆积排列，TRUE 代表水平排列
代码示例：
par(mfrow = c(1, 2)) data <- cbind(a = 1:4, b = 1:4)
barplot(data, main = 'beside = F') barplot(data, beside = T, main =
'beside = T')
效果图如下：
7) horiz : 逻辑值，默认FALSE , 当值为TRUE 时，将x轴和y轴转置；
代码示例：
par(mfrow = c(1, 2)) barplot(1:4, main = 'horiz = F') barplot(1:4,
main = 'horiz = T', horiz =T)
效果图如下：
8）col : 柱子的填充色，默认为灰色
代码示例：
barplot(1:4, col = 'green')
效果图如下：
除了设置col参数的值为一个外，还支持不同的柱子设置不同的颜色
代码示例：
barplot(1:4, col = rainbow(4))
效果图如下：
9) border : 柱子边框的颜色， 默认为 black, 当border = NA时，表示没有边框
代码示例：
barplot(1:4, col = rainbow(4), border = NA, main = 'border =
NA')
效果图如下：
10）density 和 angle : 设置柱子用线条填充，density 控制线条的密度， angel 控制线条的角度
代码示例：density 控制线条的密度
par(mfrow = c(1, 3)) barplot(rep(1,4), density = 1, main = 'density
= 1') barplot(rep(1,4), density = 2, main = 'density = 2')
barplot(rep(1,4), density = 3, main = 'density = 3')
效果图如下：
代码示例：angle 控制线条的角度， 必须和density 参数搭配使用才能发挥作用
par(mfrow = c(1, 3)) barplot(rep(1,4), density = 2, angle = 45,
main = 'angle = 45') barplot(rep(1,4), density = 2, angle = 90,
main = 'angle = 90') barplot(rep(1,4), density = 2, angle = 180,
main = 'angle = 180')
效果图如下：
11）axes ：逻辑值，控制是否显示轴线
代码示例：
par(mfrow = c(1, 2)) data <- cbind(a = 1:4, b = 1:4)
barplot(data, axes = F, main = 'axes = F') barplot(data, axes = T,
main = 'axes = T')
效果图如下：
12）axisnames ： 控制是否显示柱子的标签
代码示例：
par(mfrow = c(1, 2)) data <- cbind(a = 1:4, b = 1:4)
barplot(data, axisnames = F, main = 'axisnames = F') barplot(data,
axisnames = T, main = 'axisnames = T')
效果图如下：
13）offset ： 设置柱子的起始位置在y轴上的位置， 默认值为0
代码示例：
par(mfrow = c(1, 3)) data <- cbind(a = 1:4, b = 1:4)
barplot(data, offset = 0, main = 'offset = 0') barplot(data, offset
= 1, main = 'offset = 1') barplot(data, offset = 2, main = 'offset
= 2')
效果图如下：
