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南京城墙博物馆地处秦淮区老门东，毗邻中华门瓮城，整体建筑平面呈L形，外立面采用三层中空设计的夹丝反射玻璃，内嵌金属层和高性能太阳能热保护膜，环保节能。此外采用这种半透明的玻璃幕墙，是希望淡化博物馆自身的建筑体量，更好地融入周边的古城风貌之中。馆内总建筑面积12000平方米，藏品有1718件（套），其中珍贵文物166件（套），被国家文物局列为国家三级博物馆。
南京城墙是指明初所建的以军事防御、中央集权象征等功能为主的都城城池建筑系统。南京城墙遗产区面积607.99公顷，缓冲区面积3843.77公顷，合计4451.76公顷。2006年、2012年，南京城墙作为世界上最长、规模最大、保存真实性最好的城市城墙，两次被中国国家文物局列入《中国世界文化遗产预备名单》。
（福东海、寿南山）
南京城墙博物馆前身为1979年3月成立的南京中华门管理所，1988年成为南京市城墙管理处，主要负责对古城墙的保护、维修和管理工作。1998年设立南京市明城垣史博物馆对外开放。2014年成立南京城墙保护管理中心。2018年，始建南京城墙博物馆，历时三年建成开放。2020年3月，南京城墙保护管理中心（南京城墙博物馆）成为国际古迹遗址保护协会城防与军事遗产委员会机构会员，也是中国首个加入该机构的文博单位。