巴拿马地峡领域（1821-1855）
1821年巴拿马加入到了西蒙·玻利瓦尔所建立的大哥伦比亚共和国，与南美洲的邻国哥伦比亚共和国形成了联盟关系。自1821年联盟的形成至1903年巴拿马宣布独立期间，巴拿马使用了哥伦比亚的国旗。但在哥伦比亚旗帜中央的盾牌下，绣有“地峡领域”（Departamento del Istmo）的字样。这代表着巴拿马当时仅被哥伦比亚政府视为一个领域管理。
巴拿马联邦州（1855-1903）
1855年，巴拿马境内不少脱离哥伦比亚的独立运动得到了兴起。巴拿马的名称从“地峡领域”改为“巴拿马联邦州”（Estado Federal de Panamá），国旗盾牌下的字纹也随着改成了“巴拿马州”（Estado de Panamá）。1885年后，又改为“巴拿马省”（Provincia de Panamá）的字样。