故事梗概：上帝的摄政王则希望通过消灭尘埃，而建立永久的宗教法庭，从而永久地控制人民。但主角之一莱拉的父亲则发动了一场针对上帝和他的摄政王的战争，建立了天堂共和国，团结了许多正义的力量，包括披甲熊、天使、女巫、鬼魂等各种力量，力图保护尘埃，推翻教会的残暴统治，但他的成功必须得到两个武器的帮助，一即黄金罗盘，一即魔法神刀。根据多年前的预言，将有两个少年成为这场战争胜利、从而人类得到拯救的关键。其中之一即是阿斯里尔勋爵的女儿莱拉，还有一个则是生活在另一个世界的牛津城的威尔。他俩将扮演亚当和夏娃的角色，通过蛇的引诱，解救全人类。这个蛇的角色则是威尔所在的那个世界的女科学家马隆博士来扮演。但这些在当时并没有任何人知道。上帝的摄政王和教会也都知道了这两个救世主的存在，所以就想尽一切办法要杀害莱拉和威尔。所以，整部书其实就是两条线构成的：一是莱拉和威尔各自带着神秘的武器力图与阿斯里尔勋爵回合，帮助他建立天堂共和国，一条则是教会镇压阿斯里尔的反叛和寻找莱拉与威尔并消灭他们。
黄金罗盘：莱拉从小就被父亲托付给乔丹学院的院士抚养。突然，莱拉的很多玩伴，包括吉普赛人的很多小孩都莫名其妙的一一失踪了，整个城市都在谈论是吃人的饕餮干的坏事。终于有一天，莱拉最好的朋友罗杰也不见了。莱拉决定去寻找这些孩子。就在这时，乔丹学院来了一位神秘美丽的女士。莱拉并不知道，她就是自己的母亲库尔特夫人。库尔特夫人决定把她带在自己身边。临行前，乔
丹学院院长悄悄送给莱拉一个黄金罗盘，即可以预测未来、只有莱拉可以看得懂的真理仪。因为包括院士、天使和女巫们都知道关于莱拉有一个神秘的预言，即她将成为伊甸园里的人类之母夏娃，承担起拯救世界的重大责任，但具体她将怎样拯救世界，没有人知道。而且，这个救世主的角色必须在她完全不知情的情况下才能成功地扮演，而黄金罗盘将起到关键的作用。偶然的机会，莱拉发现库尔特夫人即是偷走孩子的罪魁祸首，而且得知孩子们都被送到北极。她悄悄逃了出去，往北极去了，一路上历经艰辛，遭遇了披甲熊、女巫、天使，悬崖厉鬼等各种历险，甚至差一点被邪恶的科学家放到精灵的切割机上。这个切割机的发明者即是库尔特夫人，她是个权力欲极强的女人，妄图凭借教会的力量取得自己向往的权力，于是她向教会提出自己研究尘埃的建议，并发现尘埃对人的影响来自精灵，如果人没有精灵，尘埃也就无意义了，所以她发明了一种精灵切割机，要把人与精灵割开。但库尔特夫人及时挽救了她。莱拉解救了所有被偷走的孩子后，继续北上，把金色罗盘送给她父亲，但她父亲已经不再需要，而是利用切割开罗杰和他的精灵的办法打开了通向另一个世界的窗口。一直为“尘埃”之说困惑的莱拉决定尾随其后，保护尘埃。就这样，她进入了另一个世界。也就是在那里，她遇到了威尔。
魔法神刀：威尔决定去寻找失踪多年的探险家父亲，其实，他父亲当年也是在探险过程中无意间跨过一个通口，进入了另一个世界，并获得了自己的精灵，成了一个可以预测未来的巫师。他知道有关两个少年将拯救人类的预言，但并不知道其中一个即是自己的儿子；而且他还预言的实现中还承担着一个重要角色，即把持有魔法神刀的人带到阿斯里尔勋爵那里。威尔在喜鹊城得到了魔法神刀，和莱拉一道继续寻找父亲。其间，他俩还偷偷回到威尔所在的牛津，并结识了研究尘埃的科学家马隆博士。这个马隆博士将扮演蛇的角色。一路上苦难不尽，他们在各个世界之间穿行。等到威尔最终找到父亲时，他得知了这把魔法神刀的意义，但父亲却牺牲了。
琥珀望远镜：莱拉和威尔穿梭于各个险象环生的黑暗世界。在披甲熊王与其它盟友的帮助下，他们深入从没有活人进入的鬼魂世界，将无数的无数亡灵从黑暗中解救出来，获得重生，这些亡灵日后成为阿斯里尔勋爵的重要力量。……他们行走在人间、地狱与天堂，与恶魔、鬼怪、教会，甚至上帝进行殊死战斗……同时他们的生命还遭遇上帝的摄政王派遣的各种杀手的威胁。甚至摄政王本人后来也亲自出动，最后，阿斯里尔勋爵和受到感召的库尔特夫人为了挽救莱拉，和摄政王一道同归于尽。威尔、莱拉、马隆博士，亚当、夏娃、蛇，终于会合了，阻止了尘埃的流失。但是，阿斯里尔勋爵的天堂共和国无法永久地存在，因为人和精灵只有在属于自己的世界里才能生存，他们可以通过窗口穿越世界，但不能长久。同时这些窗口又会导致尘埃的流失，而且每打开一个即制造一个吞噬人精灵的妖怪，所以所有的窗口必须关闭，只可以留下一个，此时，已经深深相爱的莱拉和威尔做出了巨大的牺牲，他们将惟一的窗口留给了鬼魂世界，让亡灵可以从黑暗的地下世界进入到人类世界，而他俩只能接受如同生死之隔的永别，负担起在各自的世界里建立天堂共和国的使命。
