看了讨论有2点感慨或说明:
1)这篇文章最核心的部分在最后一段话,我把它加亮,请大家再读读!
2)理论指导实践!我想大家有必要读或重读我在文章中提到的那篇文章(本周推荐4),文章中最具有现实意义的是,分析了目前41个水稻QTL图位克隆的案例,看看里面成功的得失,就可以体会对么目前工作的指导意义在哪里!
这基本上一个难以回答的问题,因为每个特定QTL的情况都不一样,上一篇小高的分析,只是理论情况,前提是染色体的每一个地方的重组频率都是一样的,但事实上,几乎染色体上每个地方的重组频率都是不一样的。在讨论这个问题之前,先明确一个概念:
1. 重组率和遗传距离的关系
重组率不等于遗传图距,简单的原因是重组率没有考虑到两个标记之间的双交换。
所以通常用2个函数来调整重组率与遗传图距的关系,就是我们Mapmaker经常用到的两个命令:
1)Haldane作图函数:x=-(1/2)ln(1-2r)(x 是图距,r是重组率)
这个函数的前提假设是理论预测的双交换单株与实际的一样,但事实上理论的双交换单株总比实际观察到的多。所以这个函数会夸大实际的连锁值。
于是常用的另一个是:
2)Kosambi作图函数:x=-(1/4)ln(1+2r)/(1-2r)
这个函数有一个假设
1)这篇文章最核心的部分在最后一段话,我把它加亮,请大家再读读!
2)理论指导实践!我想大家有必要读或重读我在文章中提到的那篇文章(本周推荐4),文章中最具有现实意义的是,分析了目前41个水稻QTL图位克隆的案例,看看里面成功的得失,就可以体会对么目前工作的指导意义在哪里!
这基本上一个难以回答的问题,因为每个特定QTL的情况都不一样,上一篇小高的分析,只是理论情况,前提是染色体的每一个地方的重组频率都是一样的,但事实上,几乎染色体上每个地方的重组频率都是不一样的。在讨论这个问题之前,先明确一个概念:
1. 重组率和遗传距离的关系
重组率不等于遗传图距,简单的原因是重组率没有考虑到两个标记之间的双交换。
所以通常用2个函数来调整重组率与遗传图距的关系,就是我们Mapmaker经常用到的两个命令:
1)Haldane作图函数:x=-(1/2)ln(1-2r)(x 是图距,r是重组率)
这个函数的前提假设是理论预测的双交换单株与实际的一样,但事实上理论的双交换单株总比实际观察到的多。所以这个函数会夸大实际的连锁值。
于是常用的另一个是:
2)Kosambi作图函数:x=-(1/4)ln(1+2r)/(1-2r)
这个函数有一个假设
