NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

2011-11-01 09:47阅读：

http://blog.sina.cn/dpool/blog/u/1257500882

最近研究6个疾病基因，需要在NCBI下载基因序列及其上下游1000bp序列，经朋友推荐，方法如下：
以基因BRAF为例
第一步：在NCBI的gene中输入BRAF（human）如下：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/673
第二步：点击右上方Genomic regions, transcripts, and products，如图：

NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

出现以下页面：

NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

点击：Go to reference sequence details，出现一下页面：

NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

选择Reference GRCh37.p5 Primary Assembly（推荐使用），在Download GenBank, FASTA, Sequence Viewer (Graphics)中点击GenBank，如图所示：

NCBI在线查找基因序列及其上下游1000bp序列

选择右上方的Change region shown，Selected region，对起始和终止位置加减即可达到选择上下游区域的目的

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