北师大生命科学学院核桃研究团队在核桃科系统进化与分子钟研究中取得突破
来源:北京师范大学官网, 2023-02-08
胡桃科(Juglandaceae)共11个属60多个物种,染色体基数(x)为16(除化香树x=15外),根据形态和分子序列建立的系统发生树存在拓扑结构上的冲突(图1)。早期核型研究揭示了胡桃科的四倍体起源,可能与杨梅科(Myricaceae, x=8)有关。胡桃属(Juglans)和山核桃属(Carya)的共线性分析表明两个属共享近期的全基因组加倍事件(Whole-genome duplication, WGD),且加倍后两个亚基因组(Subgenome)之间存在有偏分镏(Biased ractionation)现象,也表明此次WGD可能是异源多倍化事件。异源多倍化涉及种间杂交和基因组加倍,然而胡桃科是否所有物种都经历了这个WGD事件以及所涉及到的亲本尚不清楚。
该研究从头组装了胡桃科最基部类群—马尾树(Rhoiptelea
chiliantha)以及黄杞(Engelhardia
roxburghiana)两个物种染色体水平的基因组,并下载了已发表的5个核桃科物种的基因组。研究团队采用三种方法检测WGD事件,发现核桃科所有物种近期都经历了WGD事件。基因组
来源:北京师范大学官网,
胡桃科(Juglandaceae)共11个属60多个物种,染色体基数(x)为16(除化香树x=15外),根据形态和分子序列建立的系统发生树存在拓扑结构上的冲突(图1)。早期核型研究揭示了胡桃科的四倍体起源,可能与杨梅科(Myricaceae, x=8)有关。胡桃属(Juglans)和山核桃属(Carya)的共线性分析表明两个属共享近期的全基因组加倍事件(Whole-genome duplication, WGD),且加倍后两个亚基因组(Subgenome)之间存在有偏分镏(Biased ractionation)现象,也表明此次WGD可能是异源多倍化事件。异源多倍化涉及种间杂交和基因组加倍,然而胡桃科是否所有物种都经历了这个WGD事件以及所涉及到的亲本尚不清楚。
