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清净寺，入口检票（门票仅3元）
清净寺首批全国重点文物保护单位，1990年代被评为全国十大名寺之一
门楼，大门朝南，入口凹进，高12.3米，基宽6.6米，门宽3.8米
门楼用辉绿岩条石砌筑，分外、中、内三重，第一、二重皆为青石作半圆形穹顶拱门，拱尖处倒垂一朵莲花，门楼正额横嵌阿拉伯文浮雕石刻
门楼第三重为砖砌圆顶，涂垩洁白，无任何装饰，象征无限宇宙空间
门楼内东西两壁各有一巨大尖拱壁龛
祝圣亭，为保护亭内两块石碑1983年新建，小平台上两块碑，左为元至正十年（1350）的《重立清净寺碑记》碑和明万历三十七年（1609）的《重修清净寺碑记》碑，文字多，风化较严重，有不少字已看不太清
门楼顶部平台为“望月台”，乃伊斯兰教“斋月”前，伊玛目（阿訇）率老乡观望初升新月，决定穆斯林封斋和开斋日期的地方
原来望月台上还有望月亭，毁于清初，现在游客也不能上去
与门楼相连的礼拜大殿，又称为“奉天坛”，是穆斯林叩拜真主、做礼拜的地方，占地面积约600平方米，屋顶原为巨大的圆顶，于明万历年间（1607）的8.1级大地震中坍塌，现残留下花岗岩砌成的大殿四壁和巨大的尖顶窗户以及部分圆柱
奉天坛坐西朝东，西墙为朝向伊斯兰圣地麦加的正向墙，西墙上从南至北共有六个小壁龛和四座长方形门，中部砌饰一座雕刻阿拉伯文《古兰经》的巨大壁龛
奉天坛南墙，面临涂门街，全长23米，高6米，厚1.02米，立面于墙高1.83米处并排开筑8个长方形大石窗窗孔高2.85米，宽1.8米，窗顶楣各横嵌一长列浮雕阿拉伯文《古兰经》石刻
石墓盖，由整石雕刻而成，分成三至五层不等，底座宽大，逐层缩小，环刻有缠枝花卉纹、覆莲瓣纹等
碑额残件
阿拉伯文碑
各种石构件
奉天坛北墙外，有一口千年古井，供穆斯林前来举行礼拜之前汲水净身和寺众平时的生活用水
寺内北面围墙正中嵌有一方明永乐五年（1407）《敕谕》碑刻，是明成祖朱棣颁发的保护伊斯兰教寺院的文告
庭院小花园
大榕树
八卦沟
小河名“八卦沟”，河上有座“清真桥”
二进三开间的“明善堂”
明善堂首进为门厅
第一进大门门额“认主独一”，民国十一年厦门关监督唐柯三沐盥书