在距离额济纳旗东南约25公里处，有一座几乎要被巴丹吉林沙漠掩埋的城池遗址，它就是黑水城遗址。黑水城又称黑城，蒙古语称为哈拉浩特。位于干涸的额济纳河（黑水）下游北岸，是居延文化的一部分。黑水城是西夏在重要的农牧业基地和边防要塞，是元代河西走廊通往岭北行省的驿站要道，为亦集乃路，明以后城渐废。其实早在汉朝时，赶走匈奴后就有屯田驻兵，现今额济纳成为居延遗址和黑水城保护基地，成为著名的旅游风景区。
黑水城为传统的城池布局，呈长方形。全城面积超过十八万平方米，分为东西两部分。西城为军政官署和寺庙等宗教活动场所；东城则为吏民和军队居住区及仓库等。城东西各有一座城门，门宽四米五。建有瓮城，瓮城门南向。城墙高十一米，墙四角加厚，成圆锥形，顶部外侧建有女