1980年的武汉港
1984年2月，又一次改革开始，国务院批转交通部《关于长江航运体制改革方案的通知》，实行港航分管体制。将原来的长航分别组建成“长江航务管理局”和“长江轮船总公司”。原长航重庆分局改为“重庆长江轮船公司”，管理区域第一次缩小到重庆至巴东区段。同年7月，长江轮船总公司将所属船舶启用新船名。上海公司的船为“江申”加编号，武汉公司的船为“江汉”加编号，重庆公司的船为“江渝”加编号命名。
其中最大的变化就是因为葛洲坝工程蓄水后，库区航线大为改观，同时由于川东鄂西有大批民工进出，于是有大批大型远程客轮被补充到重庆分公司：原“东方红”39-57被分别改为“江渝”1-17号；除了“东方红101”改为“江渝101”以外，原“东方红”117-118号，125-126，119-124，127-129被按照编号改为“江渝”102-114。这样，重庆分公司就有了30艘大中型客轮。
1989年10月，也就是长江客运的辉煌阶段，重庆长江轮船公司所属“江渝号”系列客轮有“江渝”1-20号大型远程客轮，“江渝”101-116号中短程客轮，重庆分公司的客轮总数首次达到36艘之多，在川江、尤其是从万县到宜昌的三峡期间来往穿梭，被亲切地称为“水上巴士”。
而宜昌正好处于重庆与武汉之间，除了转运换载之地，还是川东鄂西水陆交通的交汇之处，自然就是很重要的港口，也是长江上的十大码头之一。新中国成立后，宜昌港被划为重庆管辖，在那个火红的年代里没什么争议；可是等到长航被分为三大公司各自施展拳脚的市场经济时代，武汉分公司自然就会据理力争，将宜昌港纳入到自己的麾下，这也是一大变革。
长航武汉管理局历来