1.中南大学：2000年4月，原湖南医科大学、原长沙铁道学院、原中南工业大学合并组建中南大学。
2.湖南大学：2000年，原湖南大学与原湖南财经学院合并组建新的湖南大学；2003年，湖南计算机高等专科学校并入湖南大学。
3.吉首大学：2000年原吉首大学与原吉首卫生学校合并组建新的吉首大学；2002年10月，原张家界市武陵高等专科学校并入吉首大学。
4.湖南科技大学：2003年，原湘潭工学院与原湘潭师范学院合并组建湖南科技大学。
5.长沙理工大学：2003年4月，原长沙交通学院与原长沙电力学院合并组建长沙理工大学。
6.南华大学：2000年，原中南工学院与原衡阳医学院合并组建南华大学。
7.湖南工业大学：2006年2月，原株洲工学院更名为湖南工业大学。
8.湖南农业大学：1992年4月，原湖南农学院更名为湖南农业大学。
9.中南林业科技大学：2000年11月，原湖南林业学校、原湖南林业技工学校并入原中南林学院；2005年12月，原中南林学院更名为中南林业科技大学。
10.长沙学院：2004年5月，原长沙大学（专科）组建长沙学院。
11.湖南城市学院：2002年3月，原湖南城建高等专科学校与益阳师范高等专科学校合并组建湖南城市学院。
12.
13.长沙医学院：2005年，原湘南医学高等专科学校升格更名为长沙医学院。
14.湘南学院：2003年4月，原郴州师专、原郴州医专、原郴州教育学院、原郴州师范四校合并组建湘南学院。
15.衡阳师范学院：1999年3月，原衡阳