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宋太宗赵光义赐名“石鼓书院”。宋至道三年（公元997年），衡州人李士真拓展其院，作为衡州学者讲学之所。宋景祜二年（公元1035年），朝廷赐额“石鼓书院”，与嵩阳书院、白鹿洞书院、岳麓书院并称全国四大书院
石鼓书院地处衡阳市城北蒸、湘、耒三水汇聚的石鼓山上，始建于唐元和五年（810年），是湖湘文化重要发源地之一，明徐霞客赞誉称“石鼓书院兼具滕王阁、黄鹤楼名胜之优越”；与嵩阳书院、白鹿洞书院、岳麓书院并称中国古代四大书院，素有“衡湘洙泗”“道南正脉”之誉。
石鼓书院主要由武侯祠、李忠节公祠、大观楼、七贤祠、敬业堂、合江亭等建筑构成，总占地面积约4000平方米，是中国古代最早的一所由私人创建的书院。现为衡阳市传统文化教育基地，定期组织举行研学、表演、祭祀等活动。
石鼓书院作为石鼓摩崖石刻（含石鼓书院）组成部分被湖南省人民政府公布为第九批省级文物保护单位。