男子签订48年54亩土地承包合同，没有经过村民大会，村委会称无效

村委会能否解除土地承包合同？原则上农民的承包土地在合同有效期内，村委会是无法解除的。但是，如果村委会召开村民大会讨论决定是可以解除土地承包合同的。一般情况下，村民大会单独针对某个村民的土地承包合同讨论是否解除并不存在，除非是某个村民的土地承包经营合同存在损害其他村民或者公共利益的情形。《村民委员会组织法》第24条规定，土地承包经营方案经村民会议讨论决定方可办理。
吉林辽源市东辽县男子承包了村里54亩土地，从事农业养殖经营，承包期限48年，但是，村委会换届后，认为男子承包土地48年承包费不合理，承包合同没有经过村民大会讨论通过，要求解除男子的48年承包经营合同。法院最终判决，该男子与村委会签订的54亩土地承包经营合同无效。为什么经营多年的土地，法院判决合同无效了呢？
辽源市东辽县甲路村委会（化名）有养殖场多种经营生产基地54亩，1993年开始，承包给村民用来从事养鱼和休闲山庄经营活动。2003年9月16日，甲路村委会召开村民代表大会，同意将孙某承包的甲路村山庄（原养殖场生产基地）转让给李某某经营。2006年7月2日，甲路村委会与李某某签订《合同书》。该《合同书》没有经过村民代表大会讨论通过。合同约定：原承包时间1998年