在此前结束的四个赛区比赛中，分别有16支男、女篮球队晋级全国十六强。以上届联赛全国总冠军所在为A区，进行顺时针轮转。
对应本届男篮分区赛的前四名，分别为：
西北赛区：A1太原理工大学、A2西北工业大学、A3河南大学、A4山西财经大学
东北赛区：B1清华大学、B2河北工程大学、B3中国民航大学、B4山东科技大学
东南赛区：C1华侨大学、C2浙江大学、C3宁波大学、C4中国矿业大学
西南赛区：D1武汉理工大学、D2湖北工业大学、D3湘南学院、D4国防科技大学
对应本届女篮分区赛的前四名，分别为：
东北赛区：A1北京大学、A2北京师范大学 、A3山东科技大学、A4天津财经大学
东南赛区：B1南京航天航空大学、B2南京大学、B3中国矿业大学、B4南京邮电大学
西南赛区：C1华中科技大学、C2湖南师范大学、C3中南财经政法大学、C4四川师范大学
西北赛区：D1太原理工大学、D2青海师范大学、D3西安交通大学、D4河南大学
根据竞赛规程和各支球队的赛区排名，十六强对阵情况如下：
男子组
A区（太原）
太原理工大学VS山东科技大学
湖北工业大学VS宁波大学
D区（武汉）
武汉理工大学VS山西财经大学
浙江大学VS中国民航大学
B区（泰安）
清华大学VS中国矿业大学
西北工业大学VS湘南学院
C区（杭州）
华侨大学VS国防科技大学
河北工程大学VS河南大学
女子组
A区（泰安）
北京大学VS南京邮电大学
青海师范大学VS 中南财经政法大学
D区（太原）
太原理