转:预测转录因子结合位点
JASPAR 数据库JASPAR 数据库中CORE 数据库属于高质量,非冗余转录因子数据库,包含的信息源于已经实验证实的真核生物转录因子结合位点。可供查找的物种有脊椎动物。
第一步:打开官网,以 jaspar Core Vertebrata(脊椎动物)为例。

第二步:进入主界面,在输入序列区域将查找到的启动子序列输入进去。

注:输入序列需为 FASTA 格式,即输入第一行为「>」 加「文字说明」第二行开始才为序列。

第三步:勾选想要检测的转录因子或者同一物种全部勾选(注意物种),其它选项默认,之后点击 SCAN 结果展示:

