据明《户县志》记载，北周初年（561年），万花山建云际寺，建寺后香火一直旺盛。隋大业年间，改名太平寺度僧，盛唐时，唐高宗总章元年（668年），新罗国（南朝鲜）王之孙圆测曾经在太平寺隐居精修，从事佛经著述达八年之久。唐高祖李渊和唐高宗李世民也曾在此处赏游参佛。武则天时，太平公主也曾经在太平寺出家修行，躲避和亲。此后几百年里，太平寺一直香火鼎盛，信众香客络绎不绝。但从清朝同治年间后，由于战乱，佛寺逐渐毁弃。
近年来，经政府和广大信众的努力，才将太平寺以及万花山风景区重新建成开放，让广大民众又有了一个休憩赏乐的地方。