1346 年，蒙古人围攻克里米亚半岛上热那亚人的商业阵地，带来了亚洲的瘟疫病毒，一直蔓延到俄罗斯。据估计，约有三分之一的欧洲人口在这场瘟疫中死亡。
当时的欧洲人将瘟疫解释为上帝对他们罪孽的恼怒，于是欧洲掀起了一股宗教浪潮。但声势浩大的宗教仪式只能让疾病进一步蔓延。还有许多人认为，犹太人在水井中投毒来谋害基督徒。许多城市中发生了大规模屠杀。人们渐渐从经验中意识到了疾病的传染性，在一些城市如威尼斯，建起了检疫站，患者被隔离。1453 年，瘟疫不知何故逐渐消失，但到17 世纪末还偶尔出现。之后，瘟疫因为欧洲的卫生条件改善而消失，但在落后的奥斯曼帝国还长
时间存在。