1860、1900年先后两次遭到英法联军的焚毁，昭庙残存无几，只留下红墙、琉璃牌坊和琉璃塔等遗迹。
上世纪初，熊希龄在香山办慈幼院，女子中学，并在昭庙的遗迹上建了部分建筑。
1920年，由女届红十字会办起了香山医院。
1949年，中共中央由西柏坡迁驻香山，昭庙是中共中央秘书处所在地。
1956年，香山公园开放，昭庙主要是公园的服务场所，在修复前的近几年，作为公园内部用房并未开放。
2008年，昭庙修缮工程开始提出，香山公园内昭庙的修复工程分为三期，一期是清理周边的遗迹，拆除民国等各个时期在昭庙上建起的建筑物。
二期是修缮琉璃塔、琉璃牌楼、月河、红、白台裙房和清净法智殿。
三期是修复红台上的四智殿。
2010年，在经过文物清理、遗址清查，专家论证的两年之后，5月开始动工。
昭庙修复工程主要是围绕着红台上的建筑展开的，都罡殿、四智殿等建筑物的修复方案正在研究、编制、审批中。
2012年9月底，香山昭庙修缮（一、二期）工程完工，向游客开放庙前、白台等部分景区。庙外周边、白台都已开放，红台暂不开放。
