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有关分子标记共显性

2012-09-11 17:03阅读:

有关分子标记共显性

来源: 杨蛟的日志

分子标记中,显性和共显性,指allele而言,即指所扩增的PCR产物(DNA片断)。象RAPD、ISSR等显性标记,PCR产物无法确切确定,因而无法区分杂合体(heterozygosity),只能按有带无带进行分析,记录为0/1;而SSR等共显性标记,则能区分杂合体,即二倍体及多倍体染色体DNA上的不同变异都能显现出来,而且不仅可采用0/1记录也可按扩增产物的长度(bp)进行记录和分析,是一种能区分杂合体的共显性标记,即如果同源染色体上相同的locus上,存在插入、缺失等变异,即便是单个碱基对上的差异也能同时显示并加以分辨。所以,共显性标记,在揭示遗传多样性方面要比显性标记具有更大的优势。更为重要的是,SSR引物是以外显子保守序列为引物结合点,即以已知DNA序列为基础所开发的引物,在基因组上具有特定的位置,所以在QTL等分析上,应用极为广泛。
共显性:说白了就是可以分辨出纯和的跟杂合的
这个有图示比较好理解。
有关分子标记共显性
首先, RAPD是随机引物,(可以理解只有正向引物,没有反向引物。)因此,它扩增出来的为引物结合位点到终点的长度。当然一条练上会有很多该引物结合位点,也就出现了很多片段。对于一个特定位点,我们可以理解只有一条正练可被扩增。因此,在该练上只有两种情况,有和没有。
对于SSR,有一对(正向引物和反向引物)。对于一个特定位点,两条练都可被扩增,因此有三种情况:纯
合A型,纯合B型,杂合AB型。在普通遗传学上,共显性定义为F1代中,双亲的性状同时表现的现象。这里与完全显性形成了区别,引申一点就是说:共显性能够将杂合体和纯合体从表现上区分开,而完全显性则不能。分子标记的共显性也就是这个意思,如下图所示:

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