北下关娘娘庙建于明代,原为两进院落。正殿名慈惠 殿， 三间， 硬山调大脊， 明间出轩，绘旋子彩画。大殿正中供奉木质粉彩刷金碧霞元君像一尊（据当地人言，像在60-70年代被人给拿到远郊区去了）。 明嘉靖40年(1561年)，万历19年（1591年），清康熙8年（1669年）都有重修。原庙中立万历19年《重修天仙庙碑记》，万历27年《 天仙圣母感应碑记》 和康熙八年《高粱桥西庙建新碑记》碑。众碑于文革时期被毁。
现庙己列入登记普查文物,不过庙原建筑先后两次被毁:第一次是1948年国民党嫌庙宇碍事，所以将庙宇拆除，但是当拆到正殿时长官亲自到殿顶上来拆除，结果掉了下来,后来人们就不敢拆正殿了。在60年后的2008年又准备拆掉仅存的正殿,这回倒拆了个精光,不过好在那3块古碑还留了下来,并保存在五塔寺。后来又有人提出娘娘庙是西直门外的标志性建筑,拆了很可惜,于是在拆完了之后又在原址上按清朝时的规模重建了一座,不过还是不开放。