1942年9月12日，正在中国处于抗日战争的艰难时期,罗马教宗庇护十二世册封佘山教堂为宗座乙级圣殿（minor
Basilica），这是远东第一座受到教宗敕封的圣殿，在天主教界享有和巴黎圣母院、巴西圣保罗大教堂同样的地位，成为远东地区最为著名的朝圣地。
1946年5月8日，罗马教廷又加给佘山一页特恩，准许给佘山圣母（Our Lady of Zose）行加冕礼。
1966年“文革”中，大殿遭到严重破坏，钟楼顶上的圣母托小耶稣铜像、彩色玻璃窗以及经折路上的十四次苦路像和耶稣山园祈祷像都被作为“四旧”被摧毁。1981年5月24日开始大修，至1984年结束，1985年举行复祝圣典礼。复殿之初，由于原钟楼顶上的圣母托小耶稣铜像已经不知去向，临时用铁制十字架安装在钟楼上。
2000年，上海教区发动信徒奉献，又恢复了顶部的“进教之佑圣母托小耶稣”铜像。
