文章来源:洛阳吉恩特生物科技有限公司
随着磁珠法核酸提取技术的不断普及,越来越多的实验室会进行磁珠法DNA提取,在使用的初期阶段,也会遇到各种各样的问题,近期就有许多老师和我们讨论如何利用磁珠进行全血基因组DNA的提取,我们对其中的常见问题进行了总结,供大家参考。
1、全血上样量与裂解体系
全血上样量是磁珠法全血DNA提取的经典问题,无论用什么方法,首先要解决的就是上样量问题,不同的上样量对应不同的试剂体系,上样量过多或多少都会影响裂解的效果。以GNT-B02的磁珠法全血基因组DNA提取试剂盒为例,标准上样量为200ul,上下浮动不超过100ul,搭配的裂解液用量为300-400ul,有些老师由于实验要求,需要大体积的上样量,这在实际操作中,就需要对磁珠法全血DNA提取的操作流程进行改良,一般的改良思路是按比例放大裂解体系;但有些实验的上样量达到毫升以上,这种情况下,就不能再简单的放大裂解体系了,需要先用红细胞裂解液对样品进行处理,将上样体积浓缩后,再进行磁珠法全血DNA提取的操作流程优化。
2、磁珠结团
磁珠结团是在磁珠法全血DNA提取过程中经常遇到的现象,是由磁珠本身特性和磁珠所处试剂环境两方面造成的,有些磁珠不仅在全血DNA提取过程中会结团,在其他的样本提取中也同样会结团,有些老师在初次遇到这种现象的时候会感觉不适应,其实结团现象可以用来提前预判实验结果,结团往往是吸附了大量核酸,如果哪次实验没有结团,本次的实验结果或许会不太好,不过也不能一概而论,杂质太多也是引起磁珠结团的原因。
通过修改试剂配方,优化试剂配置,可以改善磁珠法全血DNA提取过程中的结团现象,但是该工作较为复杂,需要对各种参数进行调整。不过对于磁吸速度较慢的磁珠,结团后能明显提高磁吸速度,提高实验效率,只要磁珠在洗脱步骤能够分散,而且结果也在标准范围内,磁珠结团并不会影响整体效果。
3、得率低
1、全血上样量与裂解体系
2、磁珠结团
3、得率低
