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在用RAST注释的时候,会有一个选项,是build metabolic model,选择是,在注释结束之后,你看结果会有
» Browse annotated genome in SEED Viewer
» View metabolic model
这两个选项,选择View metabolic model,你就会进入model seed模式,那么model seed 到底是个什么东西呢?
Model seed(http://www.theseed.org/models/)跟已有的kegg,metacyc不一样,他们主要集中于基因功能,代谢反应和代谢通路的归类,而model seed的功能代谢模型不仅是呈现代谢通路,而且预测这些代谢通路
在用RAST注释的时候,会有一个选项,是build metabolic model,选择是,在注释结束之后,你看结果会有
» Browse annotated genome in SEED Viewer
» View metabolic model
这两个选项,选择View metabolic model,你就会进入model seed模式,那么model seed 到底是个什么东西呢?
Model seed(http://www.theseed.org/models/)跟已有的kegg,metacyc不一样,他们主要集中于基因功能,代谢反应和代谢通路的归类,而model seed的功能代谢模型不仅是呈现代谢通路,而且预测这些代谢通路
