cFDNA和ctDNA研究用采血管—CFGenome
2017-06-01 14:44阅读：
Exo DNA ProTeck®采液管
(Blood Exo DNA ProTeck® Tubes)
用于cf
DNA和ctDNA的血液收集管（采血管）
22°C/71.6°F下，cfDNA可以稳定保存28天
在超过40°C/104°F下运输，cfDNA依旧稳定
无甲醛
（一）cfDNA稳定性
Blood Exo DNA Pro-Teck®
Tube可实现全血采集样品中cfDNA规范化（标准化）。可用于无创产前基因筛查/无创产前基因检测(NIPS/NIPT)和液体生物监测(液体活检，Liquid
Biopsy)的规范化，提高检验结果的准确性。
1. 时间稳定性(Time
Stability)
CFGenome的
Blood Exo DNA ProTeck®
tubes采集的全血，其Cell-free
DNA可以在室温(22⁰C)
下能稳定保存长达28天！
结论来自如下监测：在不同时间下，对室温保存在CFGenome的Blood
Exo DNA ProTeck® tubes中的血液，取血浆使用droplet
digital
PCR检测β-Actin基因片段，用以反映cell-free
DNA浓度，发现与初始采集时比较，保存长达28天后该基因没有发生显著改变。而K3EDTA采血管无法实现在室温下的长时间保存。在第3天，β-Actin已经呈现显著升高，cell-free
DNA浓度持续升高，至28天时，浓度升高上千倍之多。
2. ctDNA稳定性
Blood Exo DNA ProTeck®
tubes保存血样，血液中的肿瘤DNA室温(22⁰C)稳定保存28天。
该结果来自于对野生型KRAS
DNA浓度的检测：Blood Exo DNA ProTeck®
tubes能让血液中的KRAS
DNA室温(22⁰C)稳定保存28天，而K3EDTA保存管无法实现。
将来源于细胞系的已知量的KRAS外显子2
G13D突变的肿瘤cell-free
DNA作为内参照加入到采集的血样中，使用therasreen KRAS RGQ
PCR试剂盒和Rotor Gene real time
PCR仪检此内参。在K3EDTA采血管保存的血样中，发现仅在采集日可以检出，而Blood
Exo DNA ProTeck®
tubes中保存的血样，22°C下保存28天依旧可以检出。
3.
温度稳定性(Temperature
stability)
使用CFGenome的Blood Exo
DNA ProTeck®
tubes采集的全血在4⁰C到30⁰C间都能保持cell-free
DNA稳定。
无论使用Qubit® dsDNA
HS检测法，还是使用droplet digital
PCR检测RASSF1A，在CFGenome的Blood
Exo DNA ProTeck®
tubes中，6⁰C,
22⁰C或37⁰C三种保存温度下保存的血液，直到第7天cell-free
DNA浓度都没有显著改变。
4. 运输稳定性(Shipping
stability)
使用CFGenome的Blood Exo
DNA ProTeck®
tubes采集保存的血样能经受42⁰C温度，不影响血中cell-free
DNA浓度。
实验方法：将ProTeck采血管采集的血样，通过FedEx运输往哥伦比亚，亚利桑那等地，经受两天42⁰C，与室温保存的样品比较cell-free
DNA浓度没有显著改变，而在K3EDTA管中保存的血样cell-free
DNA浓度显著升高(droplet digital
PCR技术检测β-Actin基因片段)。
5.甲醛检测
NMR检测显示CFGenome的Blood
Exo DNA ProTeck® tube不含甲醛。
（二）ctDNA
稳定性
室温(22°C)下，保存在K3EDTA采血管中的血样，野生型KRAS
DNA浓度随时间延续升高，而Blood Exo DNA ProTeck®
Tubes中的血样可以保存28天。
实验方法：使用来自细胞株的KRAS外显子2
G13D突变的肿瘤cell-free
DNA作为内参添加入血样中。存放在K3EDTA采血管的血样中，仅在采集当天能检测到突变DNA，而Blood
Exo DNA ProTeck®
Tubes保存的血样，室温保存22天依旧可以检测到。
其它产品
1.
KRAS Control
KRAS Control®为KRAS exon 2 G13D
cell-free
DNA提取内参照，用于体外非侵入性肿瘤检测(液体检测Liquid
Biopsy)中。这一产品旨在提供一种用于证明患者血样提取cell-free
DNA过程成功与否的参照物，也是检测方法的参照物。
CFGenome的这一参照物是真正的cfDNA，市场上其他产品使用的是合成DNA或是基因组DNA片段化产物。
这一参照系统含10%的KRAS突变型(exon
2 G13D)的cell-free
DNA，90%为野生型KRAS的无细胞DNA作为背景。
2.
TriZo 21
Control™
TriZo 21
Control™是胎儿21号染色体三体的cell-free
DNA提取对照物，用于体外非侵入性产前21三体综合征的诊断。旨在对提取过程提供参照。这一参照系统含10%的21三体的cell-free
DNA，90%野生型的cell-free
DNA作为背景。这一对照也作为方法的对照使用。
CFGenome的参照物使用的是真正cfDNA，市场上其他产品使用的是合成DNA或是基因组DNA片段化产物。
CFGenome还有TriZo 18 Control™ and
TriZo 13 Control™等产品。
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