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如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积

2015-09-04 19:29阅读:
IamgeJ作为一个极其好用的免费工具,在生命科学中广泛应用。下面介绍一下如何测量作细胞SCRATCH WOUND ASSAY的面积测量。
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积打开ImageJ选择目标图片
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积这是一张打开的行细胞划痕实验的图片
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积
在process 中先find edges
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积单击后,图片变成如上图。
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积然后,再在process 中选sharpen,单击。
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积单击sharpen后,将显示为上图。
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积然后再选中image中的adjust--threshold
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积选中threshold后,将示上图,这时需设置为default, B&W. 同时可以调节参数。
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积这时,我们可以再次选择process--find edge,单击后,划痕将更加明显。
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积选择Analyze中的analyze particles,将显示如上图。此时需设置参数10000-infinity,并且show中显示为outlines,这样后面才会显示划痕的位置。
如何使用ImageJ测量细胞划痕实验面积点击OK后,将出现下图,左侧即为划痕的位置,非常清晰。
​这是自己的一些经验,与大家分享。当然也可以使用cell profiler,这个软件更加自动化,更简便,但是对图片要求更高。

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