云锦馆位于江宁织造博物馆，其内系统介绍南京云锦的发展历史和织造工艺，云锦为中国传统织锦工艺巅峰之作，被赞誉为“织金妆花之丽，五彩闪色之华”。
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云锦是指在南京生产的、以锦缎为主的各种提花丝织物的总称，其起源最早可追溯到东晋安帝义熙十三年（417）刘裕设立的“斗场锦署”。元至元十七年（1280），忽必烈在南京设立官办织局，并在继承元代著名“织金锦”的基础上发展和繁荣起来。至明代又进一步创造通经断纬的“妆花”织造技法，制出加金妆彩的“妆花”织物。作为元、明、清三代专供宫廷及王公贵族的专用之物，云锦不仅是一种衣料，还成为古代制度文明的集中体现。2009年南京云锦织造技艺被联合国教科文组织列入“人类非物质文化遗产代表作名录”。
云锦织造是一种有着丰厚文化内涵的传统技艺，既是宫廷文化、制度文化、礼仪文化的体现，也是民间文化、民俗文化的重要部分。其产生与发展对社会的政治、经济、文化、科技、艺术、文学、风俗等诸多方面具有重要影响。历史上，南京一直都是全国丝织业的中心，织锦业兴旺繁荣，据统计，南京丝织业兴盛之时，有近30万人以此和相关产业为生，是当时南京最大的手工产业，对南京的城市发展产生了重要的影响。
当代南京云锦技艺传承和研究资料陈列中，最具视觉冲击感的，是一幅约八、九米长的云锦《九龙图》，明黄色地，江崖海水纹，九龙色彩与形态各异，活灵活现，雍容华贵，气派非凡。
“花本”是将纸面上的设计纹样，运用“挑花结本”的工艺，编结而成的模本。花本装到提花织机上后，与机上牵线、经丝相互作用，提经织纬来完成云锦的织造。
云锦馆通过多幅明清帝王画像，展示了各个朝代、不同等级的服饰制度，式样、色彩、纹饰都非常清晰。云锦的图案囊括了植物、动物、佛道、乐器、文房四宝、人物、传统吉祥内容等写实的或几何形式的纹样。从文化内容上看，有来自民间文化的蝙蝠（福）、牡丹（富贵）、鱼（余）、石榴（多子）、桃（寿）等内容，也有反映皇室文化的龙、凤、麒麟、江崖、海水、万寿等内容。云锦的悠久历史中，产生了很多花色品种，形成了独特的品种系列，主要分为“库缎”、“织金”、“库锦”、“妆花”四大类，其中“妆花”是南京云锦特有的、最具代表性的品种。