华佗中医药文化博物馆位于安徽省亳州市，是一处介绍展示古代神医华佗医学成果以及中医药发展历史的专业性博物馆。
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华佗中医药文化博物馆地处亳州市华祖庵内，是一处浅凹字型、两层仿古水榭式建筑，古朴厚重，于2009年9月9日华佗诞辰日正式开馆。
华佗中医药文化博物馆陈列展示包括中医药起源、中医药五千年发展史、华佗及其中医药成果、中医药资源和亳州现代中医药文化发展现状五大主题。
华佗中医药文化博物馆为传颂华佗济世救人、弘扬中医药文化而设立，展陈丰富，的博大精深。步入其间，如同穿越千年时空，漫览于万古药香，俯首药圣济世青囊，观原始于针砭，品神农于百草，道神医于妙术，体百姓于疾苦。