先锋综述:非编码RNA保守性的四个维度

如何体现新发现基因功能的意义呢,进化保守被广泛作为一个体现该意义的指示器。对于编码蛋白的基因,在核苷酸和氨基酸序列的层面做简单同源性搜索就极具价值了;但对于非编码RNA的选择过程而言,要完整全面的描述清楚,这些标准就显得太窄了(意思就是说需要从更广的范围及层面来描述了)。
长链非编码RNA(LncRNA)的保守包括如下四方面内容:序列、结构、功能及同线位点的表达。
我们最近调研了两个基因敲除鼠模型,一个是与肺腺癌转移相关的转录因子(Malat1),另一个是与肺腺癌转移相关Hox基因的反义基因RNA (Hotair),结果都突出体现了非编码RNA保守的多面性。
Diederichs S. (2014) The four dimensions of noncoding RNA conservation. Trends Genet [Epub ahead of
print]. [abstract]
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如何体现新发现基因功能的意义呢,进化保守被广泛作为一个体现该意义的指示器。对于编码蛋白的基因,在核苷酸和氨基酸序列的层面做简单同源性搜索就极具价值了;但对于非编码RNA的选择过程而言,要完整全面的描述清楚,这些标准就显得太窄了(意思就是说需要从更广的范围及层面来描述了)。
长链非编码RNA(LncRNA)的保守包括如下四方面内容:序列、结构、功能及同线位点的表达。
我们最近调研了两个基因敲除鼠模型,一个是与肺腺癌转移相关的转录因子(Malat1),另一个是与肺腺癌转移相关Hox基因的反义基因RNA (Hotair),结果都突出体现了非编码RNA保守的多面性。
Diederichs S. (2014) The four dimensions of noncoding RNA conservation. Trends Genet
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