1:概念学习
不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则称为非同义突变。同义突变频率 (Ks)、非同义突变频率(Ka)、非同义突变率与同义突变率的比值(Ka/Ks)。如果Ka/Ks>1，则认为有正选择效应。如果Ka /Ks=1，则认为存在中性选择。如果Ka/Ks<1，则认为有纯化选择作用。
2:使用软件：KaKs_Calculator
3:准备文件，将由InParanoid（http://blog.sina.cn/dpool/blog/s/blog_83f77c940102vl1v.html?vt=4）
不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则称为非同义突变。同义突变频率 (Ks)、非同义突变频率(Ka)、非同义突变率与同义突变率的比值(Ka/Ks)。如果Ka/Ks>1，则认为有正选择效应。如果Ka /Ks=1，则认为存在中性选择。如果Ka/Ks<1，则认为有纯化选择作用。
2:使用软件：KaKs_Calculator
3:准备文件，将由InParanoid（http://blog.sina.cn/dpool/blog/s/blog_83f77c940102vl1v.html?vt=4）