1:文章：2015-Roary: rapid large-scale
prokaryote pan genome analysis
2:网址：http://sanger-pathogens.github.io/Roary
3:组装使用的是Velvet Optimiser, and annotated using Prokka
4:预测的编码序列中碱基N含量超过5%的核苷酸，长度短于120bp去掉，序列必须有起始和终止密码子
5:先用cd-hit进行初步筛选，相似性100%且在各个所选物种中都出现的序列作为core-gene,重复序列使用
2:网址：http://sanger-pathogens.github.io/Roary
3:组装使用的是Velvet Optimiser, and annotated using Prokka
4:预测的编码序列中碱基N含量超过5%的核苷酸，长度短于120bp去掉，序列必须有起始和终止密码子
5:先用cd-hit进行初步筛选，相似性100%且在各个所选物种中都出现的序列作为core-gene,重复序列使用