此图特点:
某个亚群的亚群,使用箭头来标明;
不同的样本来源,在每张图式图的上面进行标注;
右边的两张图是使用了同型对照;
通常情况下,首选使用FSC/SSC来划分亚群,不过有的情况下,也有人直接放出目标细胞的亚群,看下面的案例。 第五个案例[5]
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此图特点:并没有使用FSC/SSC来进行第一个亚群的划分,原因我猜可能是由于排版的问题,直接放出最关键的亚群即可。小图的右边是对每个亚群进行定量。 现在总结如下: 一、
在进行不同的亚群划分时,通常是先SSC/FSC进行画门,严格情况下,有人还会使用DAPI来区分死细胞,然后再在该门中进行目标细胞亚群的划分。 二、
从流式细胞仪中直接拷出来的流式图,或者是经Flowjo编辑过的流式图通常无法直接放在文章中,需要放在AI或PS中进行进一步的编辑与排版,例如每个样本的流式图不必都标记上marker,把相同的marker直接使用一个大的坐标系,每张流式图的上方或右侧放上样本名称。 三、
如果样本多,需要进行统计时,还要放上统计结果。 四、
在进行流式图的排版时,不同的markers直接写上就行,荧光染料通常不用标记,例如在使用F4/80-PE对细胞进行染色时,最终坐标上只用写上F4/80即可,不用写上F4/80-PE。 参考文献 1. van de Laar,
L., et al., Yolk Sac Macrophages, Fetal Liver, and Adult
Monocytes Can Colonize an Empty Niche and Develop into Functional
Tissue-Resident Macrophages. Immunity,
2016. 2. Sabatel, C.,
et al., Exposure to Bacterial CpG DNA Protects from Airway
Allergic Inflammation by Expanding Regulatory Lung Interstitial
Macrophages. Immunity, 2017. 46(3): p.
457-473. 3. Bauché, D.,
et al., LAG3+ Regulatory T Cells Restrain
Interleukin-23-Producing CX3CR1+ Gut-Resident Macrophages during
Group 3 Innate Lymphoid Cell-Driven Colitis. Immunity, 2018.
49(2): p. 342-352.e5. 4. Thomas,
G.D., et al., The biology of nematode- and IL4Ralpha-dependent
murine macrophage polarization in vivo as defined by RNA-Seq and
targeted lipidomics. Blood, 2012. 120(25): p.
e93-e104. 5. Boulenouar,
S., et al., Adipose Type One Innate Lymphoid Cells Regulate
Macrophage Homeostasis through Targeted Cytotoxicity. Immunity,
2017. 46(2): p. 273-286.