1、BWA自从2009年被发表以来已经更新换代好多次了，网上的教程也不统一，看得人云里雾里的,请大家务必下载最新版，这样即使你看到的教程是过时的，
最新版可以在这里找到http://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/
2、我们院里的服务器默认安装的版本非常低级，导致很多参数没办法用，我照着网上的教程实在是搞不定
EG:
新浪博客
1、BWA自从2009年被发表以来已经更新换代好多次了，网上的教程也不统一，看得人云里雾里的,请大家务必下载最新版，这样即使你看到的教程是过时的，
最新版可以在这里找到http://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/
2、我们院里的服务器默认安装的版本非常低级，导致很多参数没办法用，我照着网上的教程实在是搞不定
EG:
，其实吧，-f这个参数还好，用>也可以输出文件，但是这个-r就让人很恼火了，把头文件给搞掉了。
这是旧版本的
![解决BWA的参数问题，sampe，-f，-r]( "解决BWA的参数问题，sampe，-f，-r")
这是我自己下载安装的新版本的
![解决BWA的参数问题，sampe，-f，-r]( "解决BWA的参数问题，sampe，-f，-r")
PS：
3、而且不同版本的sai文件是无法转换为sam文件的
报错[E::bwa_sai2sam_pe_core]
这是旧版本的
这是我自己下载安装的新版本的
PS：
3、而且不同版本的sai文件是无法转换为sam文件的
报错[E::bwa_sai2sam_pe_core]