原文地址:蛋白质晶体分辨率大小的意义
| 分辨率在蛋白质晶体结构中定义:可以分辨二个平面的最小距离。分辨率对模型的建构所造成的影响可以直接由电子密度图看出,在低分辨率(~6 Å
)时,只能观察到由α螺旋(α-helix)所形成的圆柱形密度图;随着分辨率提高(3 Å ~ 2 Å )
,主链与支链结构就会出现,但个别原子仍无法由密度图中看出,除非分辨率可以达到1.0 Å
或更高的分辨率。蛋白质结构所能达到的分辨率主要取决于晶体内分子排列的整齐程度。小分子晶体内并没有太多的水分子,所以常能得到分辨率高于0.5
Å
的绕射数据。但因蛋白质结构由长的侧链所组成,其间又是由较弱的氢键及范德华力所维系,造成蛋白质结构富有弹性,蛋白质分子与分子的堆栈也就没有那么整齐,同时分子与分子之间的空隙由水分子来填补,也因这些空隙的水分子排列比较紊乱,所以蛋白质晶体绕射出的结果,仅有少数高分辨率晶体,一般蛋白质晶体结构的分辨率约在2.0
至3.0 Å 之间。也有人这样认为如3.0 Å,表示蛋白质氨基酸构象的变化范围如果超过3.0
Å就不能确定结构了 解析不同分辨率的蛋白质结构中可能出现的问题(X射线晶体学) |
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