在东晋慧远大师的时期，东林寺实际上是非常兴盛的，是南方佛教的中心。到了唐代大周年间，也是非常好的一段时间。
自唐武宗灭佛之后，东林寺就全面衰败。北宋年间有一个常总禅师在这住持，中兴了一段时间。到了明代，又很衰落了。
我们通过明朝文人学士王阳明描写东林寺的诗歌，就可知一二。他非常感慨，一个曾经辉煌地祖庭寺院，怎么成了这个样子？且看他的《远公诵经台》一诗：“远公说法有高台，一朵青莲云外开。台上久无狮子吼，野狐时复听经来。”
那见月律师《一梦漫言》里记载的东林寺不仅衰败，荒草萋萋，大雄宝殿都是灰尘呐，而且