玄武区少年宫的前身是1960年6月1日成立区少年之家，“文革”期间停办，1976年重新组成。1986年5月新宫落成，是南京市最早建立的区级少年宫,属于玄武区教育局直属单位。2010年被南京市教育局评为二星级少年宫。