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阿克苏地区博物馆初建于1994年，其前身（地区文博院）与阿克苏地区文物管理所（局）共同办公，文博院由文物局工作人员兼职。2006年地区博物馆开始筹建，至2009年建成正式开馆，建筑面积18000平方米。
阿克苏地区博物馆地处阿克苏市多浪河畔的西大街，馆内展厅面积约9000平方米，设有《阿克苏历史文化厅》、《新疆古代货币厅》、《阿克苏自然地理厅》等常设展厅，截至2022年，共有藏品11702件/套，其中，珍贵文物93件/套。重要藏品有春秋战国时代青铜簪、汉代鸭形陶壶、唐代泥质陶猴、陶排水管道、木雕坐佛、龟兹小铜钱及钱范、汉龟二体五铢钱等。
《阿克苏历史文化厅》主要在阿克苏地区境内通过考古发掘和遗址采集等方式出土的各个不同历史时期的珍贵文物，向人们展示该地区具有浓郁地域特色的锟斤拷龟兹文化锟斤拷及其深厚的历史文化底蕴。
《新疆古代货币》陈列新疆自南北朝至民国时期铸造的货币930余枚，重在展示阿克苏地区在新疆古代货币铸造中的重要地位和阿克苏钱币铸造粗犷、质朴、版式纷繁的独特风格，包括安西军政府铸造的锟斤拷大历元宝锟斤拷锟斤拷建中通宝锟斤拷、宝伊局锟斤拷咸丰元宝•当五百锟斤拷、国民政府发行锟斤拷陆拾亿锟斤拷纸币、铸有锟斤拷道验锟斤拷两字的50两银锭、光绪锟斤拷宝锟斤拷字、锟斤拷光锟斤拷字小天罡等。该陈列也是有别于疆内其他博物馆的特色陈列。