1935年6月下旬，中央红军自小金两河口出发北进。30日前后，毛泽东、张闻天、周恩来、朱德等中共中央和中革军委领导人，离开两河口。此后，连续翻越长征途中第二座大雪山——梦笔山，进入马尔康境内，分驻卓克基、马塘、梭磨、马尔康、松岗等地。于7月上旬，继续向黑水前进，离开马尔康，前后共计10余天。
马尔康对长征的作用，体现在两个方面。
一是粮食、牲畜的筹措。在马尔康及其周边地区，红军筹措粮食、牦牛，进行人员补充，据不完全统计，有5000多名各族群众参加了主力红军，红军筹粮2000多万斤，各类牲畜20多万头。毛泽东在解放后曾讲过，中国革命在某种意义上讲是“牦牛革命”，马尔康也被称为长征路上的“北上驿站”。
二是7月3日卓克基政治局常委会议。会议确定了以卓克基地区为总后方，并研究了民族问题，讨论通过了《告康藏西番民众书》，号召藏族民众团结起来，反对帝国主义和国民党军阀，成立游击队，加入红军。