我们在SDS电泳中有时会遇到样品在浓缩胶里面形成弥散，没有达到压缩的目的导致实验失败，因此我们需要了解浓缩胶压缩样品蛋白的原理，从而避免下一次失败。
在不连续电泳中，样品在含有高于它的pH缓冲液中进行电泳。此时样品以负离子形式存在，它在浓缩胶中（pH略低于样品）被高度浓缩呈薄层而实现提高分辨率的目的。
例如：待分离样品是血清蛋白，浓缩胶用Ph6.7的Tris-HCl Buffer 配制，电泳Buffer用ph8.3的Tris-甘氨酸，配制。
电泳开始以后，我们待分离的样品蛋白在进入pH6.7的浓缩胶中，在电场和电泳Buffer的共同作用下解离成负离子向正极泳动。同时电泳Buffer中的甘氨酸，因为其等电点为6.0所以在此过程中只有少部分解离（0.1-1%）成负离子向正极泳动。同时浓缩胶中的HCl解离度最大，几乎全部释放出氯离子向正极泳动。
根据电泳有效泳动率的公式；解离度（α）与泳动率（m）的乘积等于有效泳动率（mα）。在本次不连续电泳体系中，氯离子的有效泳动率最大称为快离子，甘氨酸电离出的负离子有效泳动率最小称为慢离子，而样品中的各种成分蛋白质的有效泳动率则介于快、慢离子之间。
因此在电泳开始的时候，快离子快速向正极泳动，慢离子和样品蛋白离子泳动滞后，因此在快离子后面形成一条离子浓度较低的低电导区域。由于电导与电势梯度成反比，因此在此区域产生了较高的电势梯度，由于泳动率（m）与电势梯度呈正比，使得慢离子和样品离子根据其α的大小，有序的加速向快离子靠拢，最后在进入分离胶的时候形成我们通常见到的压缩现象。
所以，压缩现象不能形成的主要原因是：
一、缺乏快离子，浓缩胶中的Buffer 失效。
二、缺乏慢离子，电泳Buffer 的pH 不适当。
三、电泳样品上样量过大，超过浓缩胶中Buffer的缓冲容量。
在不连续电泳中，样品在含有高于它的pH缓冲液中进行电泳。此时样品以负离子形式存在，它在浓缩胶中（pH略低于样品）被高度浓缩呈薄层而实现提高分辨率的目的。
例如：待分离样品是血清蛋白，浓缩胶用Ph6.7的Tris-HCl Buffer 配制，电泳Buffer用ph8.3的Tris-甘氨酸，配制。
电泳开始以后，我们待分离的样品蛋白在进入pH6.7的浓缩胶中，在电场和电泳Buffer的共同作用下解离成负离子向正极泳动。同时电泳Buffer中的甘氨酸，因为其等电点为6.0所以在此过程中只有少部分解离（0.1-1%）成负离子向正极泳动。同时浓缩胶中的HCl解离度最大，几乎全部释放出氯离子向正极泳动。
根据电泳有效泳动率的公式；解离度（α）与泳动率（m）的乘积等于有效泳动率（mα）。在本次不连续电泳体系中，氯离子的有效泳动率最大称为快离子，甘氨酸电离出的负离子有效泳动率最小称为慢离子，而样品中的各种成分蛋白质的有效泳动率则介于快、慢离子之间。
因此在电泳开始的时候，快离子快速向正极泳动，慢离子和样品蛋白离子泳动滞后，因此在快离子后面形成一条离子浓度较低的低电导区域。由于电导与电势梯度成反比，因此在此区域产生了较高的电势梯度，由于泳动率（m）与电势梯度呈正比，使得慢离子和样品离子根据其α的大小，有序的加速向快离子靠拢，最后在进入分离胶的时候形成我们通常见到的压缩现象。
所以，压缩现象不能形成的主要原因是：
一、缺乏快离子，浓缩胶中的Buffer 失效。
二、缺乏慢离子，电泳Buffer 的pH 不适当。
三、电泳样品上样量过大，超过浓缩胶中Buffer的缓冲容量。